Áreas de Trabajo
La genómica ha impactado diversas áreas del conocimiento, ofreciendo nuevas oportunidades para entender las bases de la diversas patologías. En el laboratorio estamos interesados en el análisis genómico funcional y bioinformático, enfocado principalmente en programas transcripcionales del cáncer, paisajes mutacionales y alteraciones somáticas del número de copias de tumores.
1) Exosomas como comunicadores celulares y posibles biomarcadores de quimioresistencia en cáncer de mama triple negativo tratado en neoadyuvancia con Antraciclinas y taxanos
La quimioterapia es la única opción de tratamiento aprobada y disponible para el cáncer de mama triple negativo (CMTN). Desafortunadamente, la resistencia a quimioterapia es una limitante importante para el éxito del tratamiento. El papel de la comunicación celular a través de vesículas extracelulares y de los RNAs-exosomales como mediadores de la quimio-resistencia en células tumorales de CMTN no ha sido ampliamente explorado. Mediante un abordaje integrativo de datos transcriptómicos derivado de experimentos in vitro, análisis in-silico y colecta prospectiva de muestras clínicas se propone identificar RNAs-exosomales candidatos para su estudio funcional y definir su participación como moduladores de respuesta a quimioterapia.
2) Genómica del cáncer
El cáncer de mama es un problema de salud pública que se reconoce como una patología heterogénea , pero la base genómica de su variabilidad sigue siendo poco conocida, sobretodo con respecto a las consecuencias de las disparidades por ancestría. En estudios previos hemos descrito algunas diferencias en la frecuencia de genes recurrentemente mutados y firmas mutacionales. En un futuro será relevante confirmar varios de los hallazgos de este estudio, así como caracterizar otros fenómenos relevantes en el cáncer de mama en mujeres mexicanas.
Otro interés es el panorama inmune de los tumores, descrito a través de estrategias “ómicas” y herramientas bioinformáticas dedicadas, con especial interés en profundizar la diversidad del infiltrado inmune, los programas inmunes de las células cancerosas y los fenotipos sustitutos, como los marcadores hematológicos.
Publicaciones Recientes
Rybinska, Ilona; Mangano, Nunzia; Romero-Cordoba, Sandra; Regondi, Viola; Ciravolo, Valentina; De Cecco, Loris; Maffioli, Elisa; Paolini, Biagio; Bianchi, Francesca; Sfondrini, Lucia; Tedeschi, Gabriella; Agresti, Roberto; Tagliabue, Elda; Triulzi, Tiziana.
SAA1-dependent reprogramming of adipocytes by tumor cells is associated with triple negative breast cancer aggressiveness.
International Journal of Cancer.
Aceptado
2024
López‑Méndez, José, José Ventura‑Gallegos, Ignacio Camacho‑Arroyo, Marcela Lizano, Alberto Cabrera‑Quintero, Sandra Romero‑Córdoba, Mariano Martínez‑Vázquez, et al
The Inhibitory Effect of Trastuzumab on BT474 Triple‑positive Breast Cancer Cell Viability Is Reversed by the Combination of Progesterone and Estradiol.
Oncology Letters 27 (1). DOI: 10.3892/ol.2023.14152
2023
Romero-Córdoba, Sandra, Mayel Chirinos, Nancy Noyola-Martínez, Nayeli Torres-Ramírez, Mitzi García-Olivares, Juan Pablo Aragón-Hernández, Ixchel Ramírez-Camacho, et al
Transcriptional Landscape of Human Trophoblast Cells Treated with Calcitriol and TGF-Β1.
Molecular and Cellular Endocrinology 579 (112088): 112088
2024
Salido-Guadarrama, Ivan, Sandra L. Romero-Cordoba, and Bertha Rueda-Zarazua
Multi-Omics Mining of LncRNAs with Biological and Clinical Relevance in Cancer
International Journal of Molecular Sciences 24 (23): 16600
2023
Calderon-DuPont D, Romero-Cordoba S, Tello JK, Espinosa A, Guerrero B, Contreras AV, et al.
Impaired white adipose tissue fatty acid metabolism in mice fed a high-fat diet worsened by arsenic exposure, primarily affecting retroperitoneal adipose tissue.
Toxicol Appl Pharmacol. 2023:116428. Epub 2023/02/22. doi: 10.1016/j.taap.2023.116428
2023
Estudiantes
| Nombre | Nivel |
|---|---|
| Dominique Cortes Pedroza | Doctorado |
| Efraín Alejandro Pérez Moreno | Doctorado |
| José Eduardo Montes de Oca Carlos | Doctorado |
| Karina Giovanna Torres Ortiz | Maestría |
| Diego Ruiz Ruiz | Licenciatura |
| Aranza Noemi Hernández Flores | Licenciatura |
| Mariela Contreras Jarquín | Estancia |